أكدت وزارة التربية والتعليم والتعليم الفني على عدم وجود أي صلة لها بما تم نشره على المواقع الإلكترونية ومواقع التواصل الاجتماعى بالحديث عن المدارس اليابانية، وما تضمنته من معلومات وبيانات أو تقدم تدريبات لأى من المُعلمين بخصوص هذه المدارس.

جدير بالذكر، أن الجهة الوحيدة المنوطة بالتعامل مع هذه المدارس هي موقع الوزارة الإلكترونى http://www.moe.gov.eg/، ووحدة مشروع المدارس اليابانية في الوزارة (الصفحة الرسمية للمدارس المصرية اليابانية -ejs)على فيس بوك الرسمي للمشروع.